根据病原微生物的传染性、感染后对人和动物的个体或者群体的危害程度，我国对病原微生物实行分类管理。病原微生物分为四类，一类最强，四类最弱。

　　一类：能够引起人类或者动物非常严重疾病的微生物，以及我国尚未发现或者已经宣布消灭的微生物。如：天花病毒、埃博拉病毒等。

　　二类：能够引起人类或者动物严重疾病，比较容易直接或者间接在人与人、动物与人、动物与动物间传播的微生物。如：新冠病毒、高致病性禽流感病毒、布鲁杆菌等。

　　三类：能够引起人类或者动物疾病，但一般情况下对人、动物或者环境不构成严重危害，传播风险有限，具备有效治疗和预防措施的微生物。如：甲肝病毒、乙肝病毒等。

　　四类：在通常情况下不会引起人类或者动物疾病的微生物。

　　第一类、第二类病原微生物统称为高致病性病原微生物。

　　根据对病原微生物的生物安全防护水平，国家对病原微生物实验室实行分等级管理。从事病原微生物实验活动应当在相应等级的实验室进行。实验室等级越高，防护级别越高，操作的病原微生物危险度也越高。